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有些企業在收到稅務稽查的時候，可能會特別地慌張，認為公司出現哪些問題，通常稅務稽查公司并不一定是公司出了問題，首先，稅局并不是隨便亂查公司，稅務稽查都是有一定嚴苛程序的，一般情況下公司被稽查有以下幾點可能。
一是被稽查局抽查到，就相似于搖號的形式，也就是各概率事件，不管公司是小，是大，多老實多規矩，都有被稽查的可能性，通過抽查公司來看公司經營管理情況，納稅情況等，這類公司通常被抽到問題都不大，只要公司沒有違紀行為都不害怕。
二是被舉報，也就是稅局接到舉報，那稅局就不得不出面來解決，并且約談公司，查公司的實際經營情況，這種案件每年都有不少，可能是同行舉報也可能是對家舉報。但只要公司沒有問題，就不怕。
三是被稅務部門掃描到，稅務部門會對每個企業有分析，一旦公司有任何的涉稅風險，稅務部門都會發出警報，不管是企業稅負率異常，公司任何一個經營異常，稅務部門都可能會報警，一旦稅務部門報警，專管員就是稽查公司。
四是企業被關聯，比如跟企業有業務往來的企業被查到偷稅漏稅等相關問題，那么公司也會被關聯到，也會納入稽查的名單，進行篩查，看公司經營管理情況，提供相關的資料證明企業業務真實性即可。
那么通常稅務稽查，都會抽查公司哪些問題？
最簡單來說，就是稽查企業的三流一致，證明企業業務真實的資料即可，一般是查公司的合同，資金流水、發票和企業上下游關系。
1，查合同。會要求企業將所有業務合同的掃描件進行查看，看合體的具體內容，結合企業的實際經營情況，看公司是否是異常交易。
2、查發票。要求查看公司的發票是否與業務合同一致，銷售方購買方，合同金額等，看公司是否存在虛開發票的問題。
3、查上下游。查詢企業合作上下游的賬簿，或者是看企業的上下游是否合規，購買方和銷售方針對同一筆交易入賬的經濟業務內容是否一致，是否矛盾。
4、查資金流。查詢企業的資金流水，一定保證發票、業務、資金三流一致，提供完整真實的證據鏈或者輔助資料。
公司可根據上述問題進行自查，避免稅務稽查時，手忙腳亂，這些也是企業日常經營過程中需要注意的問題之一。
除此外公司還可以利用一些地方性產業政策來降低企業的稅收成本，實現企業利潤的提高，降低企業的涉稅風險，增加公司的市場競爭能力，提高企業的綜合實力。
