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這些年來，伴隨著資本市場活躍，并購重組等市場交易不斷增加，稅務稽查次數不斷增多，力度也越來越大，特別是“股權轉讓”方面。那么，在公司股權轉讓的過程當中，有哪些行為會被重點稽查呢？常見的問題都有什么？接下來，我來帶你詳細了解~
一、未申報納稅
發生股權轉讓行為卻不申報繳納對應稅款的，股權轉讓兩方屬于不繳應納稅款的偷稅行為，將會受到對應稅務處罰，被投資企業若未履行報送材料的義務，亦有可能受到行政處罰。
伴隨著稅收征管的深化改革，稅務局與工商部門逐步落實和完善股權信息交換制度，個人股權轉讓信息自動交互機制的廣泛推行，納稅人想通過不申報納稅逃避稅款的目的將無法實現，否則會面臨雖轉讓股權卻不辦理變更登記的法律風險。
二、股權轉讓價款存疑
根據實踐經驗，股權轉讓價款存疑可能表現為0元轉讓、1元轉讓、等額轉讓、企業盈利但轉讓價格不合理的折價轉讓、同一企業短期內股權轉讓存在較大差異等情形，若股權轉讓價款存疑，可能引發稅務局核定征收的情形。
并非只要價格不合理即引發稅務局核定征收，若納稅人能夠證明該價格明顯偏低是基于正當理由，則稅務局將以股權轉讓兩方意定的價款予以計算應納稅額。
三、虛假申報納稅、提供資料不完整
納稅人存在虛假申報納稅，辦理股權轉讓納稅或扣繳申報時提供的資料不完整，引發稅務局合理懷疑的將可能成為稅務稽查重點對象，如不能提供完整且準確的股權原值證明材料；
提供的股權轉讓合同內容可能引發偷逃稅款合理懷疑的，如載明“兩方實際股權轉讓價款以實際付款為準”等內容；
依法應當進行資產評估但未能提供或拒不提供有效的資產價值評估報告的；
股權轉讓價款明顯偏低但不能提供有效的證明材料等情形。
四、提供資料不完整
根據《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法（試行）》，各地稅務局加強個人股權轉讓的動態管理，建立股權轉讓個人所得稅電子臺賬，將自然人股東的相關信息錄入征管信息系統，強化對每次股權轉讓間股權轉讓收入和股權原值的審核，同時伴隨個人股權轉讓信息自動交互機制在全國范圍的廣泛推行，同一自然人股東在一定期限內頻繁發生股權轉讓行為或同一企業或關聯企業的股權一定期限內頻繁被轉讓的，將被識別并作為稅務稽查重點對象。
五、企業發生注冊資本變動
當企業發生注冊資本變動時，可能涉及引入投資者導致注冊資本增加亦可能通過資本公積轉增股本，或企業減少注冊資本時，可能引發自然人股東個人所得稅納稅義務的產生，因此當企業注冊資本發生變化時，可能成為稅務稽查的重點對象。
該轉增股本的資本公積，屬于股本溢價發行形成的資本公積，不應繳納個人所得稅。檢查人員檢查發現，該企業資本公積形成于2013年，是一家醫藥公司直接股權投資形成的，沒有股票發行過程，屬于投資者投入形成的資本公積增加，而非股票溢價發行形成，不符合上述文件的要求，應繳納個人所得稅，最終做出補繳個人所得稅756萬元，罰款378萬元的處罰決定。
六、交易雙方因股權轉讓發生糾紛
交易雙方因股權轉讓事宜發生糾紛，引發訴訟或仲裁時，可能導致稅務局對該股權轉讓行為的重點關注。
這六種行為都是在股權轉讓過程中最容易發生的，今天我為大家總結再次，希望對大家有所幫助，大家快來學習一下吧，如果對相關還有想要了解的，歡迎咨詢。
