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公司在稅務稽查中企業都有哪些權益？國家的稅收法規越來越復雜，而大多數納稅人則是對稅收法規不容易把握，很容易多繳納稅款或少繳稅款從而引發稅務稽查。
稅務檢查中被檢查對象的權利：拒絕違規檢查權、回避權、管轄權、申請復議和訴訟權、要求聽證權、索要收據和拒絕違規處罰權。
1、納稅人、義務人有權向主管稅務機關了解國家稅收法規、法規的規定以及與納稅程序有關的情況。
2、要求保守秘密的權利。納稅人、義務人有權要求稅務機關為納稅人、義務人的情況保密。
3、如果稽查人員到企業檢查不出示稅務檢查證和稅務檢查通知書或人數少于兩人以上的，納稅人可以拒絕檢查。
4、稅務稽查人員與被查對象有利害關系或有其他關系可能影響公正執法的，被查企業有權要求他們回避。
5、稅務稽查人員調取賬簿及有關資料時應當填寫《調取賬簿資料通知書》、《調取賬簿資料清單》，并要在3個月內完整退還。
6、稅務稽查人員取證過程中，不得對當事人和證人引供、誘供和迫供。
7、屬于金融、部隊、尖端科學等保密單位的，必須要求稅務稽查人員提供《稅務檢查專用證明》。
8、稅務稽查人員查封納稅人的商品、貨物或其他財產時，未能提供有效的《查封(扣押)證》、《查封商品、貨物、財產清單》、《扣押商品、貨物、財產專用收據》的，納稅人可以拒絕查封。
9、稅務機關在作出行政處罰決定之前，依法有告知當事人做出行政處罰決定的事實、理由及依據的義務，當事人依法享有陳述、申辯的權利。
10、稅務機關對公民做出2000元以上的罰款(含本數)，或對法人和其他組織做出1萬元以上的罰款(含本數)，當事人依法有要求舉行聽證的權利;當事人在接到《稅務行政處罰事項告知書》后3日內向做出處理決定的稅務機關提出書面申請，逾期不提出的視為放棄聽證權益，稅務機關收到當事人聽證請求后在15日內舉行聽證。
11、當事人可以親自參加聽證，也可委托1～2人代理;委托代理的應向其代理人出具委托書，并經稅務機關或聽證主持人審核確認。
12、當事人認為聽證主持人與本案有直接利害關系的，有權申請回避;回避申請應當在舉行聽證的3日前向主管稅務機關提出，并說明理由。
13、同稅務機關在納稅上發生爭議時，可以在收到稅務機關填發的繳款憑證之日起60日內向上一級稅務機關申請復議。對復議決定不服的，可以在接到復議決定書之日起15日內向人民法院起訴。
14、當事人對稅務機關的處罰決定、強制執行措施或者稅收保全措施不服的，可以在接到處罰通知之日起或者稅務機關采取強制執行措施、稅收保全措施之日起15日內向上一級稅務機關申請復議，當事人也可以直接向人民法院起訴。
15、稅務機關使用或損毀扣押的財物、違規實行檢查措施或執行措施，給納稅人造成損失的，納稅人依法有權提出賠償。
